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山西醫科大學第一醫院傳染病科創建于1958年。目前是我省省級醫院中唯一的設有傳染性疾病的科室，是山西醫科大學肝病研究所進行臨床科研的科室，是山西省唯一培養傳染病研究生的碩士授予點，也是省內高級傳染病人才的培訓中心，它肩負著全省傳染病的醫療會診、重危病人搶救、科研及教學等任務。傳染病科建科40多年來，在各級領導的大力支持及全科同志的共同努力下，在醫療、教學、科研工作中取了較大的成績。為山西省培養了一大批傳染病專業人才。

全科在編人中有30人，包括病房、門診、醫技、實驗室四大部分。其中教授2人、副教授6人、主治醫師3人，博士3人、碩士學歷6人。是85年首批碩士學位授予點。科室人才集中，實力雄厚，有一批享有省內外較高聲譽的傳染病學術專家、教授。科內設置有肝病門診、腸道門診、普通門診及專家門診，住院病房分為二層有肝病病房、普通傳染病病房及特護病房，科內的實驗室有經驗豐富的副主任技師、主管技師從事傳染病的各項檢測工作。實驗室有最新購置的山西省第一臺定量PCR測定儀，可對多種肝炎病毒及其它病原體進行定量分析，可以作為病人應用抗病毒藥物治療前后的療效觀察依據；還有量子治療室等。科室不斷引進、推廣、應用新技術、新療法，在省內率先開展敵國清甲、乙、丙丁、戊、庚型肝炎病毒標致物以及HBV-DNA、HCV-RNA、TTV-DNA的檢測，利用自血光量子療法治療乙型腦炎病人近百例并取得顯著療效。在肝炎、肝硬化的診治方面積累了豐富的經驗；對腦囊蟲病的診治達國內領先水平。尤其是在腸源性內毒素血癥在肝炎慢性化中的作用及其防治的研究進行了大量的基礎與臨床方面研究。

自97年以來，在保證醫療、教學工作的前提下，大力開展科研工作。3年來承擔了省自然科學基金、省教委、省衛生廳科研基金十多個科研項目，科研鑒定5項，達到國內內領先水平。在有關刊物上共發表論文60余篇，其中在中華級雜志上發表論文20篇，并在國際、國內學術會議外進行交流。全科醫務人員致力于鉆研醫術和科學研究，醫教研全面發展，為2001年爭創博士學位點而努力。