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植物病理學科是山西農業大學最早招收碩士研究生的學科之一。1997年正式被批準為碩士學位授予點，2004被列為山西省重點建設學科。

研究方向：

1．植物萎焉性真菌病害的致病機理及綜合防治

2．植物真菌病害及植病生理研究

3．植物病原菌的抗藥性及防治策略

4．生物農藥的開發和利用

開設的碩士學位課程主要有外語、高級植物病理學、植物病原真菌學、植物免疫學等。

該碩士點現有教授3人，副教授3人，講師6人。有博士生導師3名，兼職導師7名。近十年來，共鑒定科研成果8項，獲省級科技成果獎5項，主編或參編專著4部、教材15部，在國內外學術刊物上發表論文120多篇，其中SCI收錄10余篇。目前在研的國家及省部級課題10項。

該碩士點擁有研究生專用研究室5個，重點實驗室1個，專業實驗室5個(普病實驗室、農病實驗室、果菜病實驗室、無菌室、標本室)以及配套的玻璃溫室、網室、計算機室、病圃等，實驗室建筑面積近800 m2。實驗配備有大量常規教學設備和數臺先進的研究儀器，能滿足研究生學習和研究的需要。