中國科學院南京土壤研究所成立于1953年，其前身為1930年創(chuàng)立的中央地質(zhì)調(diào)查所土壤研究室。自成立以來，南京土壤研究所一直肩負著為中國農(nóng)業(yè)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境建設(shè)服務(wù)的重任，凝聚和培養(yǎng)了一大批優(yōu)秀人才，面向全國的土壤資源，開展了一系列卓有成效的研究工作，先后榮獲國家級科技獎勵50余項，省部級科技獎勵200余項，逐步發(fā)展成為在土壤科學領(lǐng)域研究實力雄厚、分支學科齊全并在國際上享有較高聲譽的國家級研究中心和高級人才培養(yǎng)基地，為我國乃至世界土壤科學的發(fā)展做出了重要貢獻�！�

一、發(fā)展目標
　　
面向農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境建設(shè)中的國家需求，以土壤資源與管理、土壤肥力與調(diào)控、土壤環(huán)境與健康、土壤生物與安全為核心研究領(lǐng)域，在中國科學院現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新基地、生態(tài)與環(huán)境科技創(chuàng)新基地的組織下，推動系列重大科研計劃的實施，參與國家重大科研項目的競爭，為我國土壤資源合理利用、農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境建設(shè)提供決策依據(jù)和技術(shù)支撐。同時，瞄準國際土壤學發(fā)展前沿，強化現(xiàn)代土壤學理論的研究，繼續(xù)發(fā)揮在我國土壤科學研究中的引領(lǐng)作用，產(chǎn)出一批在國際上有影響的原始創(chuàng)新成果。加強支撐平臺建設(shè)，充分發(fā)揮野外臺站功能，提高基礎(chǔ)數(shù)據(jù)的獲取能力和研究水平。進一步完善管理體制的改革，打造具有持續(xù)創(chuàng)新能力的人才隊伍。全面推進國際化進程，建成世界一流的土壤科學研究與人才培養(yǎng)基地。

二、人員狀況
　　　
我所現(xiàn)有在編職工285人，其中專業(yè)技術(shù)人員224人。包括中科院院士2人，研究員41人，副高級研究人員64人，中初級研究人員119人。國家杰出青年基金獲得者5人，“百人計劃”及“引進國外杰出人才”入選者8人，國家“百千萬人才工程”5人，國家自然科學基金委委員會和中國科學院國際合作伙伴計劃團隊各1個。

三、人才培養(yǎng)
　　
作為國家首批具有碩士和博士學位授予權(quán)的單位之一，目前擁有1個農(nóng)業(yè)資源利用一級學科博士學位授予點，生態(tài)學和環(huán)境學2個專業(yè)博士學位授予點，擁有土壤學、植物營養(yǎng)學、生態(tài)學、環(huán)境科學、資源環(huán)境與遙感信息、地圖學與地理信息系統(tǒng)、水土保持與荒漠化防治7個碩士授予點，并建有1個博士后流動站�，F(xiàn)有在讀博士研究生120多人,碩士研究生126人。已累計培養(yǎng)研究生800多名。
四、研究及技術(shù)支撐機構(gòu)設(shè)置
　　
圍繞土壤資源與管理、土壤肥力與調(diào)控、土壤環(huán)境與健康、土壤生物與安全4大重點領(lǐng)域，設(shè)有土壤與農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展國家重點實驗室、中國科學院土壤環(huán)境與污染修復重點實驗室、土壤資源與遙感應(yīng)用研究室、土壤－植物營養(yǎng)與肥料研究室、土壤化學與環(huán)境保護研究室、土壤物理與鹽漬土研究室、土壤生物與生化研究室、土壤與環(huán)境生物修復研究中心、土壤利用與環(huán)境變化研究中心、農(nóng)業(yè)生態(tài)與區(qū)域發(fā)展研究中心、封丘農(nóng)業(yè)生態(tài)國家實驗站、紅壤農(nóng)業(yè)生態(tài)國家實驗站、常熟農(nóng)業(yè)生態(tài)國家實驗站、三峽工程生態(tài)環(huán)境秭歸實驗站、 CERN土壤分中心、南京土壤所、香港浸會大學土壤與環(huán)境聯(lián)合開放研究實驗室。此外，我所還主辦被SCI收錄為源刊的《PEDOSPHERE》（土壤圈）以及《土壤學報》、《土壤》等3份學術(shù)期刊；圖書館是聯(lián)合國糧農(nóng)組織的特約圖書館，藏有中外文書籍和期刊23萬冊；土壤標本館保存和陳列了我國不同類型及部分其他國家的近6萬號土壤標本；土壤與環(huán)境分析測試中心是國家質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局認定的國家計量認證合格單位。另外，中國土壤學會、全國土壤質(zhì)量標準化技術(shù)委員會和江蘇省土壤學會掛靠在我所。
五、項目與成果
　　
自2001年進入知識創(chuàng)新工程以來,我所先后主持承擔了3項國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展規(guī)劃(973計劃)項目,4項“十五”國家重點科技專項(863計劃)專題項目,1項國家自然科學基金重大項目,13項自然科學基金重點項目,5項國家杰出青年基金項目,以及25項院重要方向性項目等。共發(fā)表SCI收錄論文600余篇,被EI收錄論文100余篇,出版學術(shù)專著13部,有17項發(fā)明專利獲得授權(quán)。我所作為第一完成單位分別獲得國家自然科學二等獎2項、國家科技進步二等獎1項,省部級科技進步一等獎2項、二等獎 6項
六、交流與合作
　　
我所先后與30多個國家和地區(qū)建立了合作研究關(guān)系，與英國洛桑試驗站、蘇格蘭作物科學研究所、日本農(nóng)業(yè)環(huán)境研究所、澳大利亞Melbourn大學、Griffith 大學等一批國際著名研究機構(gòu)和大學簽訂了長期全面合作協(xié)議。擁有與香港浸會大學共建的"土壤與環(huán)境聯(lián)合開放研究”實驗室，并作為全球數(shù)字土壤制圖亞洲中心，承擔領(lǐng)導亞洲地區(qū)數(shù)字土壤制圖的工作。