重慶大學從2008年開始實施研究生培養機制改革，建立以科研為導向、鼓勵優秀為目的的動態獎助體系。按照國家政策，從2014年入學的研究生開始實行收費制度。學校將按照國家和重慶市的規定收取學費，同時向全日制碩士生提供以下獎、助學金：

1、國家助學金

面向全日制碩士生（在職定向除外）提供每生每年6000元的國家助學金（具體辦法請查詢http://yz.chsi.com.cn/）。

2、國家學業獎學金

在學制年限內符合條件的大部分研究生（在職定向培養、國防生及電影學院研究生除外）可獲得學業獎學金，具體辦法請查詢http://yz.chsi.com.cn/）。學業獎學金實行動態管理，每學年評選一次。

3、國家獎學金

在學制年限內符合條件的優秀研究生可申請國家獎學金（博士每生每年3萬元，碩士每生每年2萬元，每學年評選一次）。

4、新生獎學金

學校設立優秀新生獎學金，優秀者有機會獲得2萬元、1萬元、5千元的一次性獎勵。復試階段可向所報考學院申請。

5、其他獎助金

學校設立了創新基金、院士基金、國際交流基金、三助（助教、助研、助管）崗位等，具體名額和金額根據學校相關文件執行。

6、對家庭經濟困難的研究生，可按照相關文件規定申請困難補貼及助學貸款。